如果直接在指纹机上注册指纹，而不是通过通道管理软件和指纹采集仪集中采集再下传给指纹机的话，就需要指纹备份工具，以便将指纹机内的指纹数据，包括卡号、工号（针对指纹考勤机）上传到指纹备份工具中. 需要的话,可再将指纹备份工具数据库中的指纹同步到SKEMS门禁软件中（目前还不能同步到SKEPS门禁软件）。在以下情况发生时，再将指纹数据下传给指纹机中：

(1) 指纹机更换
(2) 指纹机内指纹数据损坏
(3) 新添购了一台指纹机，又不想让所有人员再次注册指纹(特别是指纹考勤机)

Smartkey可提供"指纹备份工具",用于上述目的。注意，该"指纹备份工具"为英文界面。